SwissCollNet s’engage à améliorer l'accessibilité de ses collections. Une vision commune et une stratégie à long terme favoriseront l'utilisation des collections d'histoire naturelle pour la recherche, l'enseignement et la société.

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Zoology - Invertebrates

Reconditionnement et numérisation de la collection patrimoniale suisse de fourmis d’Auguste Forel, avec un accent mis sur les types primaires.
Anne Freitag (Musée cantonal de zoologie, Lausanne), Bernard Landry (Muséum d'Histoire naturelle de Genève), Marc Neumann (Musée d'Histoire naturelle de Soleure)

Auguste Forel (1848-1931) était un entomologiste, neuroanatomiste et psychiatre suisse. Il fut l’un des plus importants myrmécologues de la fin du 19e et début du 20e siècle. Il a décrit plus de 6000 taxons (genres, espèces et sous-espèces) de fourmis. Il a également constitué l’une des plus grandes collections de fourmis du monde. Comprenant plus de 65’000 épingles, souvent avec plusieurs spécimens par épingle, et plus de 10’000 types (les spécimens témoins ayant servi à décrire les taxons), cette collection a été déposée principalement au Muséum d’histoire naturelle de Genève et au Musée cantonal de zoologie de Lausanne. Le Naturmuseum de Soleure en possède également quelques cadres.

Le travail principal consistera à digitaliser et photographier une grande partie des spécimens types, soit au moins un pour chaque taxon représenté par un type. Les données de localité et date de collecte, collecteur, détermination, nombre d’individus et castes seront relevées et intégrées aux bases de données respectives des musées. Pour la collection de Genève, la plus importante en termes de nombre d'espèces et de spécimens, un représentant de chaque espèce sera également numérisé. La collection de Lausanne et celle de Soleure seront entièrement digitalisées.

A Genève et à Lausanne, une partie de la collection est restée dans les boites d’origine utilisées par Forel qui ne répondent plus aux normes actuelles de conservation. Ce matériel sera reconditionné dans de nouveaux cadres entomologiques.

Increasing accessibility through reorganization and digitization of papered butterflies belonging to the Epstein Collection
Bärbel Koch (Cantonal Natural History Museum, Lugano)

The Epstein Collection was deposited at the Museo cantonale di storia naturale (MCSN) at the end of the 1980s. It comprises 60’000 specimens of diurnal butterflies collected by Hans Epstein and his family for over 20 years, and is estimated to inlcude 70% of the species found in the Palearctic and Nearctic regions. One third of these specimens had already been mounted before donation and could thus be reordered, revised and digitised during the past decades. However, as time during expeditions is always limited and the work required to mount insects is enourmous, many specimens were stored in glassine envelopes: around 40’000 specimens are today still in envelopes of glassine paper or newspaper sheets and are stored in various different boxes (plastic, aluminium and cigar boxes). Although the MCSN has received all the relevant documentation related to the Epstein Collection (epistolary, maps and field diaries), the detailed content of the boxes is still unknown and the difficult accessibility makes a revision and digitization challenging. The main scope of processing the papered butterflies of the Epstein Collection is to make specimen data digitally available in order to know the detailed content of the envelopes as well as to improve access of the data to experts in Switzerland and internationally for further research. Digitisation will be accompanied by a physical reorganisation of the material facilitating the finding of material and its long-term preservation.

Spiders (Araneae) of the MCSN: Reconditioning, Revision, Reorganization and Digitization of a Southern Alps collection
Lucia Pollini Paltrinieri (Cantonal Natural History Museum, Lugano)

Spiders, which unfortunately often do not enjoy a good reputation in the population, are in fact fascinating and very diverse organisms. For this reason, they are often used in bio-indication studies, including in Ticino. For regional museums, as the MCSN, it is important to have collections of the species present in the territory they represent, both as an intrinsic value for the institution itself and as reference material for researchers. In the last 35 years, samples from researches carried out in Ticino, in different environmental types and representative areas of the Canton, have been delivered in a heterogeneous way to the MCSN.

This project aims at revising, reorganising, conditioning and digitising the estimated 9’000 spider specimens from Ticino and stored at the MCSN. The reorganized collection will allow an easier management of samples in the long term, including any new material that will be deposited at MCSN in the future. Very important will be the standardisation of the structure of the database and the systematics that will make these data easily integrated into the SVNHC.

Finally, this project will promote both training and collaboration between two museums, Lugano and Basel, and the young biologist hired for this job will have the opportunity to become familiar with spider identification and systematics, as well as with museum conservation techniques.

Digitalisation, pérennisation et valorisation des collections d'éphémères et plécoptères (Insecta) conservées dans les institutions suisses
Jean-Luc Gattolliat (Cantonal Museum of zoology, Lausanne), Seraina Klopfstein (Natural History Museum Basel), Lionel Monod (Natural History Museum Geneva), Marco Bernasconi (Nature Museum Lucerne)

Les éphémères et les plécoptères sont deux ordres d’insectes de taille modeste mais de première importance pour les écosystèmes d’eau douce ; ils sont très largement utilisés comme bioindicateurs. Les collections d’éphémères et de plécoptères conservées dans les institutions muséales suisses ont une grande importance au niveau national et international ; elles contiennent le matériel qui a servi à la description de près de 700 espèces, soit 10% de toutes les espèces connues.

Nous allons procéder à la numérisation des 100 000 occurrences d’éphémères et plécoptères conservés dans les institutions suisses, à l’aide de nouvelles procédures plus performantes. Des photos à haute résolution des spécimens seront prises. Les identifications seront confirmées par des experts ; le matériel typique sera clairement individualisé, étiqueté et identifié en le confrontant à la description originale. Les collections seront conservées selon des standards leur permettant une préservation à long terme. Toutes les données extraites et les photos seront intégrées dans les bases de données des institutions puis dans le portail SVNHC.

Ce projet va également renforcer les liens entre les institutions en partageant les compétences et les connaissances. Finalement, ce projet permettra de valoriser les collections des musées et d’accroitre leur accessibilité et leur visibilité.

Digitalisation des spécimens types d'helminthes parasites décrits par des parasitologues suisses renommés
Maria Isabel Blasco Costa (Muséum d'Histoire naturelle de Genève)

La collection des helminthes parasites du Musée d'histoire naturelle de Genève (MHNG) est la plus riche de Suisse et, pour certains grands taxons, l'une des plus uniques d'Europe. Le noyau de la collection provient des collections de quelques influents parasitologues suisses au cours des 19e et 20e siècles, dont le dévouement et les découvertes sont encore méconnues du grand public. Ce projet vise à numériser les spécimens types des espèces décrites par Otto Furhmann (1871-1945), Jean-George Baer (1902-1975), George Dubois (1902-1993), ou Franco Bona (1922-2014), et les précédents scientifiques du MHNG, Claude Vaucher, Alain de Chambrier et Jean Mariaux, afin de faciliter la pratique de la conservation et de promouvoir l'échange d'informations et la mise à disposition des scientifiques de ces spécimens fragiles et précieux. La collection de Platyhelminthes parasites (vers plats) comporte 1269 enregistrements de spécimens types appartenant à 609 espèces du monde entier décrites par les chercheurs susmentionnés. Cet effort favorisera la recherche en taxonomie dans un groupe encore en expansion et établira les bases de la numérisation par microscopie d'autres taxons dont les spécimens sont aussi conservés sur des lames de microscope. Les nouvelles images et les normes élevées de conservation de cette collection seront certainement un atout pour le développement du portail en ligne des collections virtuelles suisses d'histoire naturelle.

Digitalisation de la collection malacologique de Delessert et identification des spécimens types (phase 1).
Emmanuel Tardy (Muséum d'Histoire naturelle de Genève)

Ce projet vise à digitaliser une partie de la collection Delessert, collection malacologique privée la plus importante d’Europe au 19 ieme siècle, et plus grande collection malacologique hébergée dans une institution Suisse. Cette collection, qui constitue l’ossature de la collection malacologique du MHNG, contient de nombreux types non répertoriés. Dans la pratique, nous souhaitons saisir sur la base de données 12.500 des 60.000 lots de spécimens estimés, mettre à jour la taxonomie, identifier les types et les photographier de manière standardisée.

Reconditionnement et digitalisation des collections de coléoptères de Hans Pochon et Nestor Cerutti
Sophie Giriens (Musée d'Histoire naturelle de Fribourg), Hannes Baur (Musée d'Histoire naturelle de Berne), Marco Bernasconi (Naturmuseum, Lucerne), Giulio Cuccodoro (Muséum d'Histoire naturelle de Genève), Anne Freitag (Musée cantonal de zoologie, Lausanne), Matthias Borer (Musée d'Histoire naturelle de Bâle), Janine Mazenauer (Musée d'Histoire naturelle de Fribourg)

Les collections du Musée d’Histoire naturelle de Fribourg sont une véritable mine d’or d’informations sur le passé de notre environnement. Parmi elles, se trouvent les collections de Hans Pochon (1900-1977) et du Chanoine Nestor Cerutti (1886-1940), composées de plus de 30’000 scarabées, charançons, coccinelles et autres insectes de l’ordre des coléoptères. Tous les spécimens récoltés et épinglés par ces deux passionnés d’entomologie au cours du XXe siècle sont d’une grande valeur scientifique puisqu’ils témoignent de l’état de la faune de cette époque, spécialement pour les cantons de Fribourg et du Valais. Ces collections restent toutefois intouchées depuis près de 100 ans et ont sérieusement besoin d’être remises en ordre. C’est pourquoi ce projet aura comme but de réorganiser les insectes en fonction d’une classification moderne du vivant, les stocker dans de nouveaux cadres hermétiques pour qu’ils soient protégés des nuisibles des collections, ainsi que de numériser toutes les informations des anciennes étiquettes pour qu’elles soient accessibles au monde entier. Le projet inclut aussi de visiter d’autres musées pour inventorier leurs coléoptères de Pochon et Cerutti, ainsi que d’inviter des spécialistes à vérifier l’identification des insectes de la nouvelle collection du MHNF. Ce gros travail permettra non seulement de mettre en lumière de nombreuses informations sur les insectes en Suisse, mais également d’assurer leur accessibilité à la communauté scientifique dans le futur.

Pteromalidae in Swiss Collections
Hannes Baur (Natural History Museum Bern), Marc Neumann (Nature Museum Solothurn), Yvonne Kranz-Baltensperger (Natural History Museum Bern)

The project Pteromalidae in Swiss Collections aims to establish a comprehensive database of the dry mounted specimens in as many Swiss institutions as possible. The Pteromalidae collections are housed in 7 major institutions: Natural History Museums of Aargau, Basel, Bern, Geneva, Lausanne and Solothurn, as well as in the Entomological Collection at the ETH in Zurich. The collections comprise about 22000 specimens. The Pteromalidae are a major group of parasitic wasps, important in basic and applied research. Having a complete specimen database of the Pteromalidae in Swiss Collections on the Swiss Virtual Natural History Collection (SVNHC) platform will bring the family automatically to forefront of research considerations. As most specimens were collected in the context of biological control projects, the result will not only be a specimen database, but also a database on host-parasitoid relationships. Finally, the specimens will not only be databased, but also be largely re-identified. Hence, it is to be hoped, that this project will stimulate the interest of future generations of specialists in this ecologically and economically most important group.

Collection de mollusques et de coraux : Préservation préventive, base de données, révision et partage des données
Celia Bueno (Musée d'Histoire naturelle Neuchâtel), François Claude (Info Fauna - CSCF)

La collection de mollusques et coraux du Muséum d’histoire naturelle de Neuchâtel trouve son origine il y a plus de 200 ans et contient de nombreux spécimens à haute valeur scientifique et historique. Cette collection a poursuivi son accroissement au fil des siècles jusqu’à atteindre, à ce jour, plus de 35'000 lots. Alors que la version papier de l’inventaire a été mis à jour jusqu’au début du 20ème siècle, très peu de spécimens ont été saisis dans une base de données. De plus, coquilles et coraux nécessitent un reconditionnement adéquat avec du matériel non acide pour les préserver de dégradations futures et de la poussière. Les deux ans nécessaires pour mener à bien ce projet représentent une opportunité unique tant pour sécuriser au long terme ces spécimen, pour les digitaliser dans la base de données que pour amorcer leur révision. Dans ce sens, le matériel suisse sera entièrement révisé ou déterminé par des spécialistes, puis la priorité sera mise sur les ensembles les plus représentatifs de la collection. En outre, ce projet inclus des développements de base de données pour d’une part améliorer la visibilité de la collection auprès d’une audience internationale et d’autre part pour traiter et associer un grand volume d’images aux spécimens inventoriés.

Cholevinae (Coleoptera, Leiodidae) of the world – conditioning, databasing and digitisation
Matthias Borer (Natural History Museum Basel)

The Natural History Museum Basel (NMB) has obtained a private collection of 15'922 Cholevinae (Coleoptera; Leiodidae). This collection contains 781 species (698 from the Palaearctic), including 15 holotypes and 611 paratypes of 99 species. This collection increases the number of species of Cholevinae at the NMB by over 40%. They are represented worldwide with a bit more than 2000 species. The main distribution area is in the western Palaearctic, and many species occur as endemics in a highly restricted range. The high degree of endemism is due to their often restricted mobility and their particular way of life in vertebrate nests, in underground mammal burrows, or caves. Due to their specific way of life, they can be exciting and essential indicator species for questions in biodiversity, environmental, or habitat protection.

The Chlevinae of the obtained private collection will be digitally recorded in this project. In addition, the type material (holo- and paratypes) will be photographed with high-resolution photo stacking imaging and also included in the database. The digitization will make data, including photos of the type material, of about half of all known Cholevinae species worldwide accessible to researchers and interested individuals.

The Termite Collection of Eberhard Ernst
Christoph Germann (Natural History Museum Basel)

Termites are a fascinating group of social insects that live in large states and have a pronounced caste system. Only the queen and king of a state produce offspring, while the remaining individuals are employed either as workers or soldiers. Termites are well-known for their skilfully constructed mounds and their positive effects on soil fertility. Most of the about 3,100 species live in Africa and South America, and many species are difficult to distinguish morphologically.

This project concerns the unique termite collection of Eberhard Ernst, which after his premature death reached the Natural History Museum in Basel. The collection, which consists of more than 11'000 vials with an estimated 100'000 specimens, is in urgent need of reconditioning, as E. Ernst's system with individual glass vials filled with ethanol bears the danger of desiccation of valuable specimens. We aim to bring together detailed locality and ecological data from various documents and notes and match it with the worker, soldier and king and queen specimens. The digitized collection will prove a unique resource for termite specialists, ecologists and climate change scientists from all over the world.

Campopleginae of Switzerland – time to tackle a major blind spot in biodiversity research
Seraina Klopfstein
(Naturhistorisches Museum Basel), Hannes Baur (Naturhistorisches Museum Bern), Anne Freitag (Kantonales Zoologiemuseum, Lausanne), Karin Urfer (Naturmuseum St. Gallen)

It is well known that there are many new discoveries to be made in the tropics, but it might be more surprising that also about 1/5 of the Swiss fauna is still considered to be unrecorded. Darwin wasps (Ichneumonidae), and especially their poorly researched subfamily Campopleginae, are believed to harbour many of these “hidden” species. They attack mainly the caterpillars of small moths, and due to this parasitoid lifestyle, they are at the top of the insect food web and thus play an important regulatory role in agriculture.

This project aims to fill some of the gaps in our knowledge of the Swiss biodiversity by conditioning, identifying, and digitizing about 5,800 Campopleginae specimens already preserved in the natural history collections of Basel, Lausanne, Bern and St. Gallen. Through detailed macro-photography, we are furthermore going to provide virtual access to the primary types of about 115 Campopleginae species, mainly from the J. F. Aubert collection in Lausanne.

Our knowledge on this highly neglected taxon will be drastically improved, including historical data to allow inferences about faunal changes in this ecologically and economically highly important group. The project will put applied research about the use of these parasitoids as natural enemies and biocontrol agents in agriculture on a solid basis, and the training aspects will help overcome the shortage in taxonomic expertise on these wasps in our country.

Hartmann’s molluscs. A historical collection that should be shared
Karin Urfer (Natural History Museum St. Gallen)

Karin Urfer

Naturmusem St.Gallen

The natural history museum St.Gallen owns a small but very valuable snail shell collection inherited from Johann Daniel Wilhelm Hartmann (1793-1863). He collected the shells together with his father between 1820 to 1860. This shell collection bares a number of type specimens that are of high scientific value. Currently, the shells are housed together with other shells Hartmann received from colleagues in 16 original cherrywood drawers. Unfortunately, the glue that Hartmann used at the time now slowly degenerates and the shells are getting loose. Loose shells also mean the loss of information concerning locality and the original species determination, which are written on the base of the drawers. Therefore, we intend to restore the collection and revise the species determination. With the support of the SwissCollNet we can now hire the mollusc expert Dr. Eike Neubert. He will support K. Urfer to professionally restore and redetermine the shells. We will then store and digitise these precious snail shells. Finalising this project means a complete digitalization of all Swiss snail shells housed at the Naturmuseum St.Gallen, which are then made accessible for the scientific world and everyone else who is interested in the collection of Johann Hartmann.

Identification et digitalisation des araignées non identifiées de Suisse présentes dans la collection du Muséum d'Histoire Naturelle de Genève
Lionel Monod (Muséum d'Histoire naturelle de Genève)

Le Musée d'histoire naturelle de Genève (MHNG) abrite une très riche collection d'araignées qui se classe probablement parmi les 10 meilleures au monde. Au cours du siècle dernier, plus de 3000 araignées de Suisse ont été collectées par les anciens conservateurs de la collection d'arthropodes du MHNG et par des naturalistes indépendants locaux. Cependant, la majeure partie de ce matériel n'est toujours pas identifiée en raison du manque d'intérêt des spécialistes contemporains qui restent plus focalisés sur la faune tropicale. L'objectif du présent projet est d'identifier ce matériel dormant et de mettre les données à disposition des spécialistes par le biais de plateformes naturalistes et d'inventaires de la biodiversité en ligne. Le travail prévu contribuera ainsi à augmenter la valeur et la visibilité de la collection locale d'araignées du MHNG. De plus, les données de distribution nouvellement générées permettront d'améliorer notre connaissance des aires de distribution et de la diversité arachnologique en Suisse, ainsi que d'évaluer plus précisément les changements induits par les changements climatiques et environnementaux sur cette faune au cours du siècle dernier.

Water Mites in Switzerland – conditioning and databasing
Holger Frick (Natural History Museum Basel), Laurent Vuataz (Cantonal Museum of zoology, Lausanne)

Water mites are one of the most species rich groups in fresh water ecosystems. They are used as bioindicators for water quality and on top of that visually attractive. In Europe, exist almost 1’000 species of which more than 150 are solely connected to springheads.

In Switzerland, the collection and study of water mites had a long tradition at the Natural History Museum of Basel, including unique so-called type specimens among the several 1000 microslide preparations. Recently, uncountable numbers of water mites were collected during national biodiversity initiatives and stored at the Museum of Zoology in Lausanne without further investigation. However, water mites remain understudied in Switzerland and the access to data of the collected specimens is difficult.

The Swiss water mite digitisation project will change this. Historical collections will be screened for type specimens and their data digitised. Already available data will be translated to international standards and so far untouched samples will be sorted, prepared, determined, properly stored and digitised to make the objects and object data finally available for research.

The Swiss Auchenorrhyncha Collection of Heidi Günthart
Isabelle Zürcher-Pfander (Natural History Museum Basel), Ueli Rehsteiner (Bündner Nature Museum), Jessica Litman (Natural History Museum Neuchâtel)

Heidi Günthart from Dielsdorf (ZH) has investigated and documented the Swiss Auchenorrhyncha fauna for more than 50 years. As one of the first female entomologists in the country, she has contributed significantly to the current state of knowledge and over time has built up an Auchenorrhyncha collection that is unique in Switzerland. Thanks to her research, the number of reported species from Switzerland has increased from 70 to almost 500. Most of the records originated from the Swiss National Park (SNP) and the surroundings.

The collection, which was donated to the Natural History Museum Basel (NMB) by Heidi Günthart in 2012, comprises approx. 140 plastic boxes with around 60 glass tubes each. There is a total of 486 species from 15 families with about 31,000 specimens.

The collection of Heidi Günthart needs to be integrated into the existing entomological collection of the NMB and specimen records digitised.

The revised collection will serve as a reference for Auchenorrhyncha, unique for Switzerland, and thus support the scientific potential of collections for present and future research and expertise in taxonomy.

Three-dimensional digitization of insect type collections
Michael Greeff (Entomological Collection, Biocommunication & Entomology, ETH Zürich) Lukas Keller (Zoological Museum of the University of Zürich), Marco Valerio Bernasconi (Nature Museum Lucerne), Jessica Litman (Natural History Museum Neuchâtel)

In biological nomenclature, "types" are specimens that are present when a species is described. In natural history collections, types are among the most valuable specimens and are studied by researchers worldwide. They are at considerable risk of damage or complete loss due to excessive handling, shipping, and inappropriate storage during loans. To protect these valuable type specimens, the current project will generate digital representations of the physical specimens by 3D imaging. These can easily be sent around the world and worked on. 3D technologies allow not only for detailed studies of traditional morphological features such as distances, textures, and patterns, but also for measuring surface areas and volumes, which so far have been neglected in taxonomic descriptions. The applicants would be the first entomological collections to establish 3D imaging in Switzerland. In the current project, around 1'200 name-bearing type specimens will be 3D scanned using photogrammetry. In addition, special use cases are being investigated in (inter)national collaborations, e.g. scanning of very small, flat or relatively large insects as well as genital specimens. A user group and a workshop on 3D imaging will help other Swiss collections to introduce the technology in their own institutions.